某暗部的少女共栖

东京西部的巨大「学园都市」。这座人口多达 230 万、约八成都是学生的城市，实施为开发超能力而设计的特殊课程，学生们的能力从「无能力(Level 0)」到「超能力(Level 5)」，被划分为六个等级。这是个拥有远超越世间常识的科学技术、任何人都被赋予科学能力，能够安全生活，宛如梦一般的教育机构。而在和平的背后，存在着「暗部」组织，承接那些绝不能公诸于世的肮脏工作。 由四名少女组成的精锐部队「道具」，能够自由操纵氮气、负责铁壁般防御的绢旗最爱、擅长运用爆裂物与陷阱，左右战场的芙兰达·塞维伦。可以感应能力者发出的微弱力量，借此追踪目标的泷壶理后。以及，学园都市仅有七人的「超能力(Level 5)」之一，麦野沈利。 在她们面前，出现了「第五位」少女。与她的相遇，使「道具」踏入新的黑暗。